Fabian Deitelhoff

Gefangen im magischen Viereck zwischen studieren, schreiben, lehren und Ideen umsetzen…

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Onlinekurse von iversity

4. September 2013 Fabian Deitelhoff

Iversity LogoOnlinekurse sind im Trend. Immer mehr Anbieter schießen aus dem Boden und bieten viele Kurse mit einem sehr breiten Themenspektrum an. Wobei Anbieter vielleicht das falsche Wort ist, denn viele von den sogenannten MOOCs (Massive Open Online Course) werden kostenfrei angeboten.

Neben Coursera, dass ich schon einmal in einem Beitrag erwähnt hatte, ist mit Iversity eine weitere Möglichkeit vorhanden, Onlinekurse zu buchen. Einer der Unterschiede ist, dass diese Kurse zuvor von der Community ausgewählt wurden.

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Kategorie: Studium, Weiterbildung Stichworte: Community, coursera, German, Iversity, MOOC, Onlinekurse, ROSALIND, Studium, Weiterbildung

Lesedauer: 4 Minuten, 859 Wörter Kommentar verfassen

ROSALIND: Solutions for HAMM, PERM & LEXF

28. Februar 2013 22. April 2015 - 22:28 Fabian Deitelhoff

It’s time for another ROSALIND project update. In this blog entry I will explain the solutions of the last three solved problems. These have the IDs HAMM, PERM and LEXF. One of them was quite easy. The solutions for the other two took much more effort than the previous problems.

Additionally I changed some organizational stuff in the Visual Studio 2012 solution and refactored some unit tests and code.

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Kategorie: .NET, Bio-Informatik, C#, English, ROSALIND Stichworte: .NET, Bio-Informatik, C#, English, ROSALIND, TDD

Lesedauer: 5 Minuten, 1048 Wörter Kommentar verfassen

ROSALIND: Solutions for DNA, RNA, REVC & GC

23. Februar 2013 07. Februar 2016 - 16:45 Fabian Deitelhoff

After a while and some German blog posts about my ROSALIND efforts I write this entry to publish my solutions for the first four ROSALIND problems. As described in the ROSALIND project section on this blog, I will write the upcoming posts about ROSALIND in English. I think this makes definitely more sense as to write them in German. So this post will describe my solutions for the four problems with the IDs DNA, RNA, REVC and GC.

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Kategorie: .NET, Bio-Informatik, C#, English, ROSALIND Stichworte: .NET, Bio-Informatik, C#, English, ROSALIND, TDD

Lesedauer: 1 Minute, 275 Wörter 2 Kommentare

Coursera: Freie Online-Kurse

21. Februar 2013 03. September 2013 - 18:21 Fabian Deitelhoff

Ich möchte einen kleinen Blog-Artikel dazu nutzen, um auf coursera aufmerksam zu machen. Die Plattform bietet kostenlose Online-Kurse an, die von Lehrpersonal verschiedenster Universitäten durchgeführt werden.

Das Angebot an Kursen deckt dabei eine sehr breite Spanne ab. Laut eigener Aussage auf der Website nutzen schon über 2.7 Millionen Menschen das Angebot, kostenlose Bildung zu bekommen, die völlig unabhängig von der geografischen Lage, Zeit oder Geld ist. Ich persönlich habe mich vor circa einer Woche in den Kurs zu Compilerbau eingeschrieben. Bei vielen Kursen besteht die Möglichkeit, sich auf verschiedene Arten einzuschreiben. Die eine Möglichkeit ist der sogenannte self-study-Modus. Dabei bekommt der Teilnehmer am Ende keine Bescheinigung über eine erfolgreiche Teilnahme. Das ist eher einer Art Schnupperkurs, da man auch nicht gezwungen ist, die Übungsaufgaben durchzuführen und vor allem müssen diese nicht fristgerecht eingereicht werden. Aufgrund meines akuten Zeitmangels habe ich zunächst diese Möglichkeit gewählt. So kann ich mir die Kurseinheiten sehr genau einteilen und bin nicht an Abgabetermine gebunden. Der andere Modus ist die reguläre Einschreibung. Dabei ist man genau an den vorgegebenen Zeitrahmen gebunden und muss auch die Übungsaufgaben bearbeiten und einreichen, wenn der Kurs erfolgreich bestanden werden soll. Die Zeiten, wann ein Kurs stattfindet, sind immer ausgewiesen. Diese gilt es also zu beachten, wenn ein Kurs belegt werden soll.

Sehr gefreut hat mich die Nachricht über Twitter, dass das ROSALIND-Projekt, dass ich zurzeit auch bearbeite, in einem Kurs über Bioinformatik verwendet wird. Wann genau der Kurs stattfinden wird, steht momentan noch nicht auf der Kursseite. Ich bin gespannt, auch wenn ich dazu im Moment leider keine Zeit mehr hätte.

Kategorie: ROSALIND, Weiterbildung Stichworte: coursera, German, Online-Kurse, ROSALIND, Weiterbildung

Lesedauer: 3 Minuten, 717 Wörter 1 Kommentar

ROSALIND: Der Projektaufbau

6. Dezember 2012 25. März 2013 - 14:54 Fabian Deitelhoff

Nach zwei einführenden Artikeln zum ROSALIND-Projekt komme ich in diesem Artikel zum Thema Projektaufbau. Das soll auch gleichzeitig der letzte organisatorische Artikel zum Thema sein. Anschließend möchte ich meine ersten Implementierungen vorstellen.

Der Projektaufbau

Zur Lösung der Probleme habe ich mich für C# 4.5 und Visual Studio 2012 entschieden, was nicht ganz überraschend sein sollte. Abbildung 1 zeigt den Aufbau der Visual Studio Solution, die vier Projekte enthält.

Visual Studio Solution für das ROSALIND-Projekt.

Abb. 1: Visual Studio Solution für das ROSALIND-Projekt.

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Kategorie: .NET, Bio-Informatik, C#, ROSALIND Stichworte: .NET, Bio-Informatik, C#, German, ROSALIND, TDD

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Einreichungen bei ROSALIND

3. Dezember 2012 25. März 2013 - 14:55 Fabian Deitelhoff

In meinem vorherigen Blog-Artikel zum Thema ROSALIND habe ich einen kurzen Überblick über das Projekt und die Plattform gegeben. In diesem Artikel möchte ich kurz auf ein paar organisatorische Dinge eingehen, bevor ich meine Lösungen zu den ersten Problemstellungen vorstelle.

Ablauf einer Einreichung

Jeder Lösungsvorschlag muss innerhalb einer bestimmten Zeitspanne eingereicht werden. Wurde anhand der Beispieldaten eine Lösung implementiert, kann über die Schaltfläche Download Dataset eine umfangreichere Datei heruntergeladen werden. Diese Datei enthält die Daten eines konkreten Lösungsversuchs als simplen Text. Ab dem Zeitpunkt des Downloads läuft ein Timer mit 05:00 Minuten Laufzeit. Während dieser Zeitspanne muss auf Basis der heruntergeladenen Datei die Lösung in das entsprechende Textfeld eingegeben oder als Datei hochgeladen werden. Das erfordert eine Implementierung, beispielsweise über Unit-Tests, bei der die Quelldatei ohne großen Aufwand angepasst beziehungsweise ausgetauscht werden kann.

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Kategorie: .NET, Bio-Informatik, C#, ROSALIND Stichworte: .NET, Bio-Informatik, C#, German, ROSALIND, TDD

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